Kuopion yliopisto Kuopion yliopisto Terveys, ympäristö, hyvinvointi
Tutustu yliopistoon Opiskelu Tutkimus Ajankohtaista In English
 
Tapahtumat
2009
2008
2007
2006
2005
2004
2003
 
Tiedotteet
2009
2008
2007
2006
2005
2004
2003
 
Apurahat
 
Työpaikat

Tiedotteet 2009

Uutta tietoa geenien aktivoitumisesta

Aika: 07.08.2009

Kuopion yliopiston biokemian yksikössä toimiva professori Carsten Carlbergin tutkimusryhmä on havainnut ennen tuntemattoman geenien aktivoimiseen liittyvän mekanismin. Sitä käsittelevä tutkimus julkaistiin 7. elokuuta arvovaltaisessa Cell-lehdessä. Tutkimus oli osa nykyisin MIT-yliopistossa Yhdysvalloissa post-doc -tutkijana työskentelevän Tatjana Degenhardtin väitöstyötä.

Uusi löytö liittyy solutuman kromosomeissa sijaitsevien geenien aktivoimiseen. Geenin aktivoituessa sen DNA luetaan lähetti-RNA:ksi, joka puolestaan sisältää geenin lopputuotteen eli valkuaisaineen rakennusohjeet. Geenien aktivoitumista on pidetty tasaisesti etenevänä tapahtumana, mutta kuopiolaistutkijat havaitsivat, että tutkitun malligeenin aktivoiminen tapahtuukin noin 60 minuutin sykleissä. Solu siis ”päättää” tunnin välein, tarvitseeko sen jatkaa geenin aktivaatiota. Jos tälle ei ole enää tarvetta, esimerkiksi tilanteessa, jossa aktivaation alulle pannut signaali on häipynyt, geenin aktivaatio voidaan tutkimuksessa havaitun mekanismin kautta nopeasti lopettaa.

Laboratoriossa tehtyjen solukokeiden lisäksi tutkimuksessa hyödynnettiin molekyylimallinnusta, jonka avulla solukokeiden havainnot voitiin selittää mekanistisesti molekyylitasolla. Menetelmä perustuu syklisesti aktivoitujen geenien säätelyalueille sitoutuvien, aktivaatioon osallistuvien proteiinikompleksien toiminnan matemaattiseen mallinnukseen. Carlbergin mukaan tutkimus olikin tärkeä esimerkki siitä, kuinka geenien aktivaation kaltainen monimutkainen biologinen ilmiö on mahdollista kuvata tarkasti siihen osallistuvien komponenttien käyttäytymisestä saadun tiedon perusteella.

Tutkimuksen pääasiallinen rahoittaja oli EU:n Marie Curie -ohjelmaan kuuluva NucSys-tutkijankoulutusverkosto, jota professori Carlberg koordinoi. Tutkimusryhmä kuuluu myös Suomen Akatemian rahoittamaan Sydän- ja verisuonitautien ja tyypin 2 diabeteksen tutkimuksen huippuyksikköön sekä pohjoismaiseen SYSDIET-huippututkimusyksikköön.

Lisätietoja:

Professori Carsten Carlberg, p. 040 3553 062, +352 46 66 44 6267, carsten.carlberg(at)uku.fi
Cell, 7 August 2009, Vol 138, No 3
NucSys
Sydän- ja verisuonitautien ja tyypin 2 diabeteksen tutkimuksen huippuyksikkö
SYSDIET


 
Kuopion yliopisto, PL 1627, 70211 Kuopio, vaihde: (017) 162 211, s-posti:etunimi.sukunimi@uku.fi